好氧堆肥發酵簡單的說，就是將禽畜糞便的水分及C/N比調整到合適的比列，在好氧菌的發酵下，堆體上升到一定溫度，有機質得到分解、病原菌被殺死的過程。影響堆肥發酵過程的因素主要有C/N比（碳氮比）、溫度、水分、發酵菌、通風量。

 

　　堆肥發酵一般分為好氧堆肥和厭氧堆肥兩種。好氧堆肥是在有氧情況下的有機物料分解過程，其代謝產物主要是二氧化碳、水和熱；厭氧堆肥是在無氧條件下有機物料的分解過程，厭氧分解最后的代謝產物是甲烷、二氧化碳和許多低分子量的中間產物，如有機酸等。

 

　　一、好氧堆肥發酵原理

 

　　好氧堆肥是在有氧條件下，利用好氧微生物的作用來進行的。在堆肥過程中，畜禽糞便中的可溶性物質通過微生物的細胞膜被微生物直接吸收；而不溶的膠體有機物質，先被吸附在微生物體外，依靠微生物分泌的胞外酶分解為可溶性物質，再滲入細胞。整個過程大致可分為三個階段：

 

　　① 中溫階段。中溫階段也稱產熱階段，是指堆肥過程的初期，堆層基本呈15～45℃的中溫，嗜溫性微生物較為活躍并利用堆肥中可溶性有機物進行旺盛的生命活動。這些嗜溫性微生物包括真菌、細菌和放線菌，主要以糖類和淀粉類為基質。

 

　　② 高溫階段。當堆溫升至45℃以上時即進入高溫階段，在這一階段，嗜溫微生物受到抑制甚至死亡，取而代之的是嗜熱微生物

 

　　可溶性有機物質繼續被氧化分解，堆肥中復雜的有機物如半纖維素、纖維素和蛋白質也開始被強烈分解。

 

　　③ 降溫階段。在發酵后期，只剩下部分較難分解的有機物和新形成的腐殖質。此時微生物的活性下降，發熱量減少，溫度下降，嗜溫性微生物又占優勢，對殘余較難分解的有機物做進一步分解，腐殖質不斷增多且穩定化，堆肥進入腐熟階段，需氧量大大減少，含水率也降低，堆肥孔隙度增大，氧擴散能力增強，此時只需自然通風。

 

　　二、好氧堆肥發酵工藝

 

　　堆肥實際就是廢棄物穩定化的一種形式，但它需要特殊的濕度、通氣條件和微生物以產生適宜的溫度。一般認為這個溫度要高于45℃，保持這種高溫發酵可以使病原菌失活，并殺死雜草種子。

 

　　好氧發酵正是因為可以轉化重金屬，減輕毒性。可以分解有機質，加快植物吸收等優點深受種植戶的愛戴。然而好氧堆肥發酵受環境溫度的影響很大，環境氣溫低，進而堆肥發酵初始溫度達不到，致使有機肥發酵不完全甚至完全不發酵。而未完全腐熟的有機肥施放田地會帶來燒根燒苗、土壤缺氧等一系列問題。