堆肥發(fā)酵過程較為簡(jiǎn)單，一共分為兩個(gè)階段，即前期主發(fā)酵階段和后發(fā)酵階段。

　　1、主發(fā)酵階段（一次發(fā)酵）

　　主發(fā)酵階段可在露天或發(fā)酵裝置內(nèi)進(jìn)行，通過翻推或強(qiáng)制通風(fēng)向堆積層或發(fā)酵裝置內(nèi)供給氧氣。在露天堆肥或發(fā)酵裝置內(nèi)堆肥時(shí)，由于原料和土壤中存在的微生物作用而開始發(fā)酵。

　　首先是易分解物質(zhì)分解，產(chǎn)生C02和H20，同時(shí)產(chǎn)生熱量，使堆溫上升，這些微生物吸取有機(jī)物的碳氮營(yíng)養(yǎng)成分。在細(xì)菌自身繁殖的同時(shí)，將細(xì)胞中吸收的物質(zhì)分解而產(chǎn)生熱量。

　　發(fā)酵初期物質(zhì)的分解發(fā)酵作用是靠中溫菌(30～40℃是為最適宜生長(zhǎng)溫度)進(jìn)行的，隨著堆溫上升，最適宜溫度45～65℃的高溫菌取代了中溫菌。在此溫度下，各種病原菌均可被殺死。一般將溫度升高到開始降低為止的階段稱為主發(fā)酵階段，以生活垃圾為主體的城市垃圾及家畜糞尿好氧堆肥，主發(fā)酵期約為3～10天。

　　2、后發(fā)酵階段（二次發(fā)酵）

　　經(jīng)過主發(fā)酵的半成品被送到后發(fā)酵工序，將主發(fā)酵工序尚未分解的易分解有機(jī)物和較難分解的有機(jī)物進(jìn)一步分解，使之變成腐殖酸、氨基酸等比較穩(wěn)定的有機(jī)物，得到完全成熟的堆肥制品。一般把物料堆積到1～2m高，進(jìn)行后發(fā)酵，并要有防止雨水流入的裝置。有的場(chǎng)合還需要翻堆和通風(fēng)，通常不進(jìn)行通風(fēng)，而是每周進(jìn)行一次翻堆。

　　發(fā)酵時(shí)間的長(zhǎng)短，決定于堆肥的使用情況。例如，堆肥用于溫床(能夠利用堆肥的分解熱)時(shí)，可在主發(fā)酵后直接使用；對(duì)幾個(gè)月不種作物的土地，大部分可以不進(jìn)行后發(fā)酵而直接施用堆肥。
　　對(duì)一直在種作物的土地，則需要使堆肥進(jìn)行到不能發(fā)生奪取土壤氮的程度，后發(fā)酵時(shí)間通常在20～30天以上。
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